Kakaonibs kan bruges som et  alternativ til mørk chokolade og kan erstatte chokoladestykker i kage og muffins. Brug dem f.eks. i brownies, chokoladekager, lagkagebunde og cookies. Kakaonibs giver et rent smagsudgangspunkt og kan hjælpe til med at differentiere smagen af bagværk mod en højere intensitet af chokolade. Det kan derfor med fordel også bruges sammen med chokolade i dejen.

Man kan også bruge kakaonibs som en snack på farten, som drys over müsli, is, frugtsalat og i mange andre sammenhænge.